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本周hzangs在最新文獻中選取了12篇分享給大家，第1篇文章研究使用長度長測序技術分析發現人腦中細胞外囊泡攜帶有全長mRNA並且對RNA的包裝具有選擇性；第2篇文章介紹了腹膜來源小細胞外囊泡蛋白質組學特徵與卵巢癌患者預後的關係；第4篇文章研究了腫瘤來源凋亡囊泡對腫瘤細胞的調控作用；第6篇文章介紹了細菌來源的工程化囊泡對骨質疏鬆的治療作用；第10篇文章驗證了共生菌來源的工程化囊泡作為腫瘤疫苗的潛在可行性。

1.Human brain small extracellular vesicles contain selectively packaged, full-length mRNA. 

人腦小細胞外囊泡含有選擇性包裝的全長 mRNA。

[Cell Rep] PMID: 38578831

摘要：腦細胞釋放並吸收含有生物活性核酸的小細胞外囊泡（sEV）。據推測，sEV 交換有助於患病大腦中神經病理變化的傳播。韦德国际使用短讀長和長讀長測序評估未患病 (ND) 個體和阿爾茨海默病 (AD) 個體死後大腦 sEV 的 mRNA。sEV 轉錄組與大量組織的轉錄組不同，顯示出基因的富集，包括編碼核糖體蛋白的 mRNA 和轉座元件，例如人類特異性 LINE-1 (L1Hs)。AD 與 ND sEV 相比，顯示出炎症相關 mRNA 的富集和突觸信號傳導 mRNA 的消耗。來自培養的鼠原代神經元、星形膠質細胞或小膠質細胞的 sEV mRNA 顯示出與人腦 sEV 的相似性，並揭示了細胞類型特異性包裝。使用長讀長測序的神經 sEV 轉錄本中大約 80% 是全長的。對富含 sEV 的同工型的基序分析闡明了可能與 sEV 負載相關的 RNA 結合蛋白。總的來說，韦德国际發現大腦 sEV 中的 mRNA 是完整的、選擇性包裝的，並且在疾病中發生改變。

2.Proteomic profiles of peritoneal-derived small extracellular vesicles correlate with outcome in ovarian cancer patients. 

腹膜來源的小細胞外囊泡的蛋白質組學特徵與卵巢癌患者的預後相關。

[J Clin Invest] PMID: 38564289

摘要：癌症來源的小細胞外囊泡（sEV）能夠改變腫瘤微環境並促進腫瘤進展。卵巢癌 (OvCa) 是一種致命的惡性腫瘤，優先通過腹腔擴散。因此，此類囊泡分泌到腹膜液中可能是該疾病傳播和行為的決定因素。韦德国际設計了一項前瞻性觀察研究來評估腹膜液源性 sEV (PFD-sEV) 對 OvCa 臨床結果的影響。為此目的，招募了兩個患者隊列，包括接受診斷或細胞減滅手術的 OvCa 病例，以及作為良性婦科疾病接受腹部手術的非腫瘤患者作為對照。從手術樣本中系統提取 PFD-sEV 使韦德国际能夠觀察到與癌症診斷、疾病階段和鉑化療敏感性相關的顯着定量和定性差異。PFD-sEV 的蛋白質組學分析有助於識別分子途徑和感興趣的蛋白質，並對 S100A4和 STX5 進行生物學驗證。此外，對高級別漿液性卵巢癌(HGSOC) 中 PFD-sEV 蛋白質組譜的無監督分析揭示了兩個簇，在總生存率方面具有不同的結果。總之，PFD-sEVs 內容的綜合表徵提供了預後價值，對 HGSOC 臨床管理具有潛在影響。

3.Advances of machine learning-assisted small extracellular vesicles detection strategy. 

機器學習輔助小細胞外囊泡檢測策略的進展。

[Biosens Bioelectron] PMID: 38340580

摘要：細胞外囊泡（EV），特別是小細胞外囊泡（sEV）的檢測對於探索其生理特性和臨床應用具有重要意義。sEV 的異質性在區分不同類型的細胞和疾病中起着至關重要的作用。機器學習憑藉其卓越的數據處理能力，提供了一種解決方案來克服傳統檢測方法的局限性，從而準確分類 sEV 亞型和來源。主成分分析、線性判別分析、偏最小二乘判別分析、XGBoost、支持向量機、k近鄰、深度學習以及主成分-線性判別分析等組合方法已成功應用於檢測和 sEV 的識別。本綜述重點關注通過 sEV 進行細胞識別和疾病預測的機器學習輔助檢測策略，並總結了這些策略與表面增強拉曼散射、電化學、電感耦合等離子體質譜和熒光的集成。比較了不同基於機器學習的檢測策略的性能，並評估了各種機器學習模型的優點和局限性。最後，韦德国际討論了當前方法的優點和局限性，並簡要概述了基於機器學習的 sEV 分析領域的潛在研究方向。

4.Tumor-derived apoptotic extracellular vesicle-mediated intercellular communication promotes metastasis and stemness of lung adenocarcinoma. 

腫瘤源性凋亡細胞外囊泡介導的細胞間通訊促進肺腺癌的轉移和幹細胞性。

[Bioact Mater] PMID: 38481566

摘要：細胞凋亡長期以來被認為是抑制腫瘤形成的重要機制，在腫瘤的進展和治療過程中，大量的刺激可以誘導細胞凋亡。此外，腫瘤來源的凋亡細胞外囊泡（apoEV）不可避免地被活腫瘤細胞吞噬，促進腫瘤異質性。了解apoEVs調節腫瘤細胞的機制對於增強韦德国际對腫瘤轉移和復發的認識至關重要。在此，韦德国际進行了一系列體內和體外實驗，報告腫瘤來源的apoEVs促進肺腺癌（LUAD）轉移、自我更新和化療耐藥。從機制上講，韦德国际證明apoEVs通過啟動上皮-間質轉化程序和上調幹細胞因子SOX2的轉錄來促進腫瘤轉移和幹細胞性。此外，韦德国际發現由apoEVs轉運的ALDH1A1通過增加受體腫瘤細胞中乙醛脫氫酶的活性來激活NF-kB信號通路。此外，靶向 apoEVs-ALDH1A1 顯着消除了這些效應。總的來說，韦德国际的研究結果闡明了凋亡腫瘤細胞和活腫瘤細胞之間依賴 apoEV 的細胞間通訊的新機制，促進癌症幹細胞樣群的形成，這些發現表明apoEVs-ALDH1A1 可能是用於LUAD轉移和復發的潛在治療靶點和生物標誌物。

5.Mesenchymal glioma stem cells trigger vasectasia-distinct neovascularization process stimulated by extracellular vesicles carrying EGFR. 

間充質膠質瘤幹細胞在攜帶 EGFR 的細胞外囊泡的刺激下觸發血管擴張獨特的新生血管形成過程。

[Nat Commun] PMID: 38570528

摘要：由於對潛在機制了解不足以及與腫瘤分子景觀的聯繫不明確，阻礙了針對膠質母細胞瘤（GBM）的新生血管形成。在這裏，韦德国际報告人類神經膠質瘤幹細胞（GSC）的不同分子亞型觸發不同的內皮反應，涉及血管生成或周圍血管生長。後一個過程由間充質（但不是原神經）GSC 選擇性觸發，並由能夠將 EGFR/EGFRvIII 轉錄物轉移至內皮細胞的細胞外囊泡 (EV) 子集介導。通過藥理學（達克替尼）或基因（基因編輯）抑制內皮細胞中 EGFR 的表達和磷酸化，可在體外消除其 EV 反應並在體內破壞血管擴張。EGFR 的治療性抑制顯着延長了 VEGF 阻斷對小鼠的抗癌作用，同時消除了血管擴張並延長了生存期。因此，由致癌EGFR 細胞間轉移驅動的血管擴張可能代表 GBM 子集中的新治療靶點。

6.Synthetic biology-based bacterial extracellular vesicles displaying BMP-2 and CXCR4 to ameliorate osteoporosis.

基於合成生物學的細菌細胞外囊泡展示 BMP-2 和 CXCR4 以改善骨質疏鬆症。

[J Extracell Vesicles] PMID: 38576241

摘要：骨質疏鬆症（OP）是一種以骨量低和骨微結構脆弱為特徵的系統性骨病。OP 的常規治療療效有限且具有長期毒性。合成生物學使基於細菌細胞外囊泡 (BEV) 的治療策略成為治療 OP 的有希望的替代方案。在這裏，韦德国际構建了重組益生菌大腸桿菌Nissle 1917-pET28a-ClyA-BMP-2-CXCR4（ECN-pClyA-BMP-2-CXCR4），其中BMP-2和CXCR4與BEV表面蛋白ClyA融合過表達。隨後，韦德国际分離出工程化 BEVs-BMP-2-CXCR4 (BEVs-BC) 用於 OP 治療。工程化的 BEV-BC 在體內表現出良好的骨靶向性。此外，BEVs-BC具有良好的生物相容性和顯着的促進BMSCs成骨分化的能力。最後，基於合成生物學的 BEV-BC 顯着預防了卵巢切除 (OVX) 小鼠模型中的 OP。總之，韦德国际利用合成生物學一步構建了具有骨靶向和骨形成功能的BEVs-BC，為OP提供了一種有效的策略，具有巨大的產業化潛力。

7.Multiparametric Single-Vesicle Flow Cytometry Resolves Extracellular Vesicle Heterogeneity and Reveals Selective Regulation of Biogenesis and Cargo Distribution. 

多參數單囊泡流式細胞術解決了細胞外囊泡的異質性並揭示了生物發生和貨物分佈的選擇性調節。

[ACS Nano] PMID: 38578701

摘要：哺乳動物細胞釋放一系列異質的細胞外囊泡 (EV)，這些細胞外囊泡通過其攜帶的物質促進細胞間通訊。為了解決 EV 異質性並確定貨物是否被分配到選定的 EV 群體中，韦德国际開發了一種名為「EV 指紋識別」的方法，該方法使用定量單 EV 流式細胞術收集的多參數數據的降維來識別不同的囊泡群體。發現 EV 群體可以通過膜順序和 EV 大小的組合來辨別，這兩者都是通過對摻入脂質雙層的親脂性染料Di-8-ANEPPS 的熒光特徵進行多參數分析獲得的。通過分別消融小 GTP 酶 Rab27a 和 EV 相關四跨膜蛋白CD63 的過度表達，對 EV 分泌和生物發生進行分子擾動，揭示了 EV 群體以及貨物分佈的獨特和選擇性改變。雖然 Rab27a 不成比例地影響所有具有高膜順序的小型 EV 群體，但 CD63 的過表達選擇性地增加了一個具有中間膜順序的小型 EV 群體的產生。隨後的多重實驗表明，EV 貨物具有獨特的非隨機分佈，CD63 和 CD81 分別選擇性地分為較小和較大的 EV。這些研究不僅提出了一種探測 EV 生物發生的方法，而且揭示了貨物的選擇性分配如何導致 EV 異質性。

8.Circulating tumor cells shielded with extracellular vesicle-derived CD45 evade T cell attack to enable metastasis. 

循環腫瘤細胞用細胞外囊泡衍生的 CD45 進行屏蔽，以逃避 T 細胞攻擊從而實現轉移。

[Signal Transduct Target Ther] PMID: 38575583

摘要：循環腫瘤細胞（CTC）是一部分癌症患者遠處轉移的前體。更好地了解 CTC 的異質性以及這些 CTC 在血行傳播過程中如何存活，可以為癌症轉移的治療預防奠定基礎。CTC 如何逃避免疫監視和免疫細胞的消除仍然難以捉摸。在這項研究中，韦德国际明確鑑定了一個 CTC 亞群，其受到細胞外囊泡 (EV) 衍生的 CD45（稱為 CD45+ CTC）的保護，可抵抗 T 細胞攻擊。研究發現，較高比例的CD45+ CTC與癌症患者較高的轉移發生率和較差的預後密切相關。此外，CD45+腫瘤細胞精心設計了免疫抑制環境，並且CD45+ CTC在體內表現出比CD45- CTC明顯更強的轉移潛力。從機制上講，腫瘤表面表達的 CD45 與 T 細胞上的 CD45 形成細胞間CD45-CD45 同親性相互作用，從而防止 CD45 從TCR-pMHC 突觸中排除，導致 TCR 信號轉導減弱並抑制免疫反應。總之，這些結果表明，EV 衍生的 CD45 修飾的 CTC 在免疫逃避和轉移方面的能力未被充分認識，這為 靶向 CTC EV 衍生的 CD45 內化以預防癌症轉移提供了理論依據。

9.The impact of hUC MSC-derived exosome-nanoliposome hybrids on α-synuclein fibrillation and neurotoxicity. 

hUC MSC 衍生的外泌體-納米脂質體雜合體對α-突觸核蛋白原纖維顫動和神經毒性的影響。

[Sci Adv] PMID: 38569030

摘要：α-突觸核蛋白（αSN）的澱粉樣蛋白聚集放大了神經退行性疾病（ND）例如帕金森病（PD）的發病機制。因此，阻止聚集或將自組裝重定向到毒性較小的聚集體可能具有治療作用。在這裏，韦德国际使用來自人臍帶間充質幹細胞（hUC MSC）的外泌體（Ex）和含有黃芩素（Ex-NLP-Ba）和橄欖苦苷（Ex-NLP-Ole）的納米脂質體的混合物來改進大腦特異性納米載體。該雜交體含有脂質膜、Ex 蛋白和黃芩素或橄欖苦苷。熒光共振能量轉移分析證實了它們的正確整合。雜化物降低了αSN原纖維化的程度並干擾二次成核和解聚。它們不僅降低了αSN的致病性，而且增強了藥物在細胞內的內化，超越了單獨的NLP的功效，並且還在細胞模型中穿過了血腦屏障。韦德国际的結論是，Ex 可以成功提取並與 NLP 有效合併，同時保留其原始特性，這表明作為針對 PD 等 ND 的治療診斷藥物輸送工具具有巨大潛力。

10.Programmed Nanocloak of Commensal Bacteria-Derived Nanovesicles Amplify Strong Immunoreactivity against Tumor Growth and Metastatic Progression. 

共生細菌衍生的納米囊泡的編程納米斗篷可增強針對腫瘤生長和轉移進展的強免疫反應性。

[ACS Nano] PMID: 38502546

摘要：共生微生物群的最新發現證明了腫瘤內細菌作為腫瘤有吸引力的分子靶標在改善癌症治療方面的巨大前景。然而，直接利用體內抗菌策略（例如抗生素）來增強癌症治療通常會導致效果不確定，這主要是由於選擇性差和潛在的副作用。在這裏，根據乳腺癌患者具有豐富共生細菌的臨床發現，韦德国际開發了一種可激活的生物界面，通過用響應性納米斗篷封裝共生細菌衍生的細胞外囊泡（BEV），以增強針對瘤內細菌和乳腺癌的免疫反應性。韦德国际發現，界面隱形 BEV (cBEV) 不僅克服了嚴重的全身副反應，而且通過細胞間反應性免疫原性表現出增強的免疫原性，通過激活cGAS-STING 途徑促進樹突狀細胞成熟。作為一種預防措施，納米隱形 cBEV 疫苗接種實現了針對細菌感染的強大保護，在很大程度上提供了針對腫瘤挑戰的預防效率。當與免疫檢查點抑制劑抗 PD-L1 抗體聯合治療時，聯合方法引發了有效的腫瘤特異性免疫反應，協同抑制腫瘤進展並減輕肺轉移。

11.Extracellular vesicles released by transforming growth factor-beta 1-preconditional mesenchymal stem cells promote recovery in mice with spinal cord injury. 

轉化生長因子-β1預處理間充質幹細胞釋放的細胞外囊泡可促進脊髓損傷小鼠的恢復。

[Bioact Mater] PMID: 38312519

摘要：脊髓損傷 (SCI) 會導致神經炎症、神經元死亡和嚴重的軸突連接。通過內源性神經幹細胞(eNSC) 減輕神經炎症、保護殘留細胞和促進神經元再生是 SCI 治療的潛在策略。間充質幹細胞釋放的細胞外囊泡 (EV) 已成為 SCI 後的病理介質和細胞療法的替代品。在本研究中，將未經處理的間充質幹細胞（對照，C-EV）和經TGF-β1處理的（T-EV）間充質幹細胞分離的EV注射到SCI小鼠體內，比較治療效果並探討潛在機制。韦德国际的研究首次證明T-EVs的應用顯着增強了NSCs的體外增殖和抗凋亡能力。將 T-EV 輸注到 SCI 小鼠中，增加了反應性小膠質細胞從 M1 到 M2 極化的轉變，減輕了神經炎症，並增強了急性期殘留細胞的神經保護。此外，T-EV 增加了損傷周圍 eNSC 的數量。因此，T-EV 進一步促進神經突生長，增加軸突再生和髓鞘再生，並促進慢性階段的運動恢復。此外，在 Rictor-/-SCI 小鼠中使用 T-EV（條件性敲除 NSC 中的 Rictor）表明，T-EV未能充分增加 eNSC 的激活並改善神經發生，這表明 T-EV可能通過靶向 mTORC2/Rictor 通路誘導 eNSC 激活。綜上所述，韦德国际的研究結果表明 T-EV 在 SCI 治療中發揮着重要作用，並且可以通過 mTORC2/Rictor 信號通路增強 eNSC 的激活來優化 T-EV 對 SCI 治療的療效。

12.Isolation and Enrichment of Extracellular Vesicles with Double-Positive Membrane Protein for Subsequent Biological Studies.

用雙陽性膜蛋白分離和富集細胞外囊泡，用於後續生物學研究。

[Adv Healthc Mater] PMID: 37942845

摘要：特定細胞外囊泡 (EV) 亞群的分離和富集對於精準醫學至關重要。然而，目前的方法主要依賴於單一陽性標記，並且容易受到可溶性蛋白質或雜質的干擾。這一限制是細胞外囊泡在生物研究中廣泛應用的重大障礙。在此，提出了一種利用鄰近連接測定（PLA）和 DNA-RNA 雜交的新方法，以促進 EV 膜上兩種蛋白質的結合，從而能夠分離和富集具有雙陽性膜蛋白的完整 EV，然後使用用於捕獲和酶裂解以釋放分離的 EV 的功能化磁珠。分離的 EV 亞群可進一步用於細胞攝取研究、高通量小 RNA 測序和乳腺癌診斷。因此，開發和實施用於分離和富集特定 EV 亞群的專門系統可以加強該領域的基礎和臨床研究。

今天的整理就到這裏。希望大家可以有所收穫。大家下周見！

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